У нас была выездная налоговая проверка соответственно бухгалтерских документов, с кадров затребовали приказы по предприятию, приказы по кадрам, больничные и расчеты к ним, заявления работников на предоставление стандартных налоговых вычетов, справки 2НДФЛ которые приносят при трудоустройстве от предыдущего работодателя.
У нас был несчатный случай на производстве. соответственно длинный больничный и потом док-ты по инвалидности - это вот запросили на предмет правильного налогообложения больничных выплат.
А вообще как я поняла это им все нужно было, чтобы проверить правильность начисления налогов с ФОТ.
Советую проверить приказы на премирование, депремирование и прочие связанные с деньгами

налоговая ведение кадрового учета не проверяет