запись в труд книжке , Публикация №988139

Ничего не делать. Такие ситуации могут возникнуть (например при предоставлении отпуска с последующим увольнении).
В стаж в Вашем случае будет засчитываться один из задвоенных периодов:

п.22. Правил подсчета и подтверждения страхового стажа для определения размеров пособий по временной нетрудоспособности, по беременности и родам (утв. приказом Министерства здравоохранения и социального развития РФ от 6 февраля 2007 г. №91)
"В случае совпадения по времени периодов работы (службы, деятельности), включаемых в страховой стаж, учитывается один из таких периодов по выбору застрахованного лица, подтвержденный заявлением, в котором указывается выбранный для включения в страховой стаж период."

подскажите как правильно внести запись в трудовую книжу: работник работает в должности бухгалтер, с 01.11.2009 ему присвоена внутридолжностная категория "ведущий бухгалтер" на основании решения тарификационной комиссии.

В штатном расписании есть такая вакансия, но я все таки думаю что не нужно делать перевод сотрудника, а просто на основании решения тарификационной комиссии внести эту запись об изменении.

На основании Решения тарификационной комиссии должен быть издан Приказ: либо о переводе сотрудника на должность "ведущий бухгалтер", либо о присвоении этой категории.
В случае, если будет приказ о присвоении категории, Вы делаете запись в ТК:
"Присвоена категория ведущий бухгалтер" со ссылкой на Приказ.

А на какой должности он будет работать при этом? Ведущий бухгалтер? Должна ли она быть в ШР? И нужно ли работника по факту оформления в программе (1С, к примеру)"перевести" на эту новую "заслуженную" должность?