Во-первых, что Вы подразумеваете под "гибким графиком работы"? Этот график предусматривает работу данного работника в субботу или воскресенье? Во вторых, не торопитесь выставлять "статусы". Если Ваш сотрудник всё-таки дойдет до больницы и ему там всё оформят в соответствии с правилами выдачи листков нетрудоспособности, никакого прогула не будет (будет другой порядок оплаты этого больничного листка). В третьих, думаю, что даже в случае если на эти два дня у работника не будет оправдательных документов, суд может признать причину его невыхода на работу уважительной.
Так что я бы не торопилась с увольнением за прогул... Чревато... Попробуйте по соглашению сторон.
Есть два типа людей: одни катят мир, а другие бегут рядом и кричат: «Боже, куда катится этот мир?»