написал: как тогда прописать в ПВТР время перерыва для отдыха и питания? Прописать, что в связи с непрерывном производством график перерывов для отдыха и питания устанавливается совместно с графиком работ?
В ПВТР прописывают все режимы работы , которые есть в организации (у вас же и пятидневщики, и сменный). Это отдельные пункты . И уже в каждом пункте и прописываете - где есть фиксированный, а где в соответствии с утвержденным графиком.